濁河温泉クロスカントリーコースは、標高1,700~1,800mに位置し、当センターからは約1.7km離れたところに立地しています。1周1,300mおよび400mの周回コースがあり、幅2mの赤土を固めたクロスカントリーコースとなっています。こちらのコースは、高低差（73m）を活用した持久的トレーニングに適しているのが特徴です。陸上中長距離走のトレーニングのみならず、トレイルランニングや格闘技、球技系の種目のランニングトレーニングにも活用いただけます。